Kui täpne on Sangeri sekveneerimine?
Kui täpne on Sangeri sekveneerimine?

Video: Kui täpne on Sangeri sekveneerimine?

Video: Kui täpne on Sangeri sekveneerimine?
Video: Exploring JavaScript and the Web Audio API by Sam Green and Hugh Zabriskie 2024, Mai
Anonim

Sangeri järjestamine 99,99% täpsus on kliiniliste uuringute "kuldstandard". järjestamine . Uuemad NGS-tehnoloogiad on aga muutumas tavaliseks ka kliiniliste uuringute laborites tänu nende suuremale läbilaskevõimele ja väiksematele kuludele proovi kohta.

Samuti küsiti, miks on NGS parem kui Sanger?

Sanger sekveneerimine võib järjestada ainult ühte fragmenti korraga. Sest NGS kasutab voolurakke, mis suudavad siduda miljoneid DNA tükke, NGS saab lugeda kõiki neid jadasid korraga. See suure läbilaskevõimega funktsioon muudab selle suure hulga DNA sekveneerimisel väga kuluefektiivseks.

Lisaks, mis on Sangeri järjestuse mõte? Sangeri järjestamine on ahelat lõpetavate dideoksünukleotiidide selektiivse lisamise protsess DNA polümeraasi poolt DNA in vitro replikatsiooni käigus; see on kõige laialdasemalt kasutatav meetod SNV-de tuvastamiseks.

Seejärel võib ka küsida, mis vahe on Sangeri järjestamisel ja järgmise põlvkonna sekveneerimisel?

järgmiseks - põlvkonna järjestamine (NGS) tehnoloogiad on sarnased. Kriitiline erinevus Sangeri järjestuse vahel ja NGS on järjestamine maht. Samal ajal kui Sanger ainult meetod järjestused üks DNA fragment korraga, NGS on massiliselt paralleelne, järjestamine miljoneid fragmente samaaegselt jooksu kohta.

Kuidas ahela lõpetamise järjestus töötab?

Sangeri DNA järjestamine on tuntud ka kui kett - lõpetamine meetod järjestamine . Tulemuseks on ddNTP-d lõpetamine DNA ahelast, kuna ddNTP-del puudub nukleotiidide vahelise fosfodiestersideme moodustamiseks vajalik 3'-OH rühm. Ilma selle sidemeta kett moodustunud nukleotiididest on lõpetatud.

Soovitan: