Mis vahe on Sangeri järjestamisel ja järgmise põlvkonna sekveneerimisel?
Mis vahe on Sangeri järjestamisel ja järgmise põlvkonna sekveneerimisel?

Video: Mis vahe on Sangeri järjestamisel ja järgmise põlvkonna sekveneerimisel?

Video: Mis vahe on Sangeri järjestamisel ja järgmise põlvkonna sekveneerimisel?
Video: Nanoball Sequencing | DNA Nanoball Sequencing | 2024, November
Anonim

järgmiseks - põlvkonna järjestamine (NGS) tehnoloogiad on sarnased. Kriitiline erinevus Sangeri järjestuse vahel ja NGS on järjestamine maht. Samal ajal kui Sanger ainult meetod järjestused üks DNA fragment korraga, NGS on massiliselt paralleelne, järjestamine miljoneid fragmente korraga ühe jooksu kohta.

Pealegi, kuidas järgmise põlvkonna sekveneerimine töötab?

Põhimõte taga Järgmise põlvkonna järjestus (NGS) sarnaneb Sangeri omaga järjestamine , mis põhineb kapillaarelektroforeesil. Genoomne ahel on fragmenteeritud ja iga fragmendi alused tuvastatakse emiteeritud signaalide järgi, kui fragmendid ligeeritakse matriitsi ahelaga.

Samamoodi, miks on NGS parem kui Sanger? NGS on oluliselt odavam, kiirem, vajab oluliselt vähem DNA-d ja on rohkem täpne ja usaldusväärne kui Sanger järjestamine. Vaatame seda rohkem tihedalt. Sest Sanger sekveneerimisel on iga lugemise jaoks vaja suurt hulka matriitsi DNA-d.

Mida sel viisil mõeldakse järgmise põlvkonna sekveneerimise all?

Järgmise põlvkonna järjestus (NGS, NextGenSeq) on uus meetod järjestamine genoomid suure kiirusega ja madala hinnaga. Seda tuntakse ka kui teise põlvkonna sekveneerimine (SGS) või massiliselt paralleelselt järjestamine (MPS). Kasutatakse ka FTDNA mitokondriaalse DNA täisjärjestuse testi järgmise põlvkonna järjestus tehnoloogia.

Kuidas erineb järgmise põlvkonna sekveneerimine traditsioonilisest järjestamisest?

Kontseptuaalselt peamine erinevus vahel järgmise põlvkonna sekveneerimine ja veel traditsiooniline järjestus meetodeid nagu Sanger järjestus on et järgmise põlvkonna järjestamine on suuteline järjestus ühe jooksuga palju rohkem nukleotiide, mida me nimetame suure läbilaskevõimega.

Soovitan: