Miks on NGS parem kui Sanger?
Miks on NGS parem kui Sanger?

Video: Miks on NGS parem kui Sanger?

Video: Miks on NGS parem kui Sanger?
Video: Sanger sequencing and NGS 2024, Mai
Anonim

Näidissuurus

NGS on oluliselt odavam, kiirem, vajab oluliselt vähem DNA-d ja on rohkem täpne ja usaldusväärne kui Sanger järjestamine. Vaatame seda rohkem tihedalt. Sest Sanger sekveneerimisel on iga lugemise jaoks vaja suurt hulka matriitsi DNA-d

Inimesed küsivad ka, millised on järgmise põlvkonna sekveneerimise eelised?

Igal neist on spetsiifiline eelised kriteeriumide jaoks: lugemise pikkus, täpsus, tööaeg ja läbilaskevõime. Lisaks DNA järjestuste analüüsile, progresseerumist järjestamine tehnoloogiate tulemusena on analüüsitud teisi bioloogilisi komponente, nagu RNA ja valk, samuti seda, kuidas need interakteeruvad keerulistes rakuvõrkudes.

Võib ka küsida, miks Sangeri järjestust ikka veel kasutatakse? Sangeri järjestamine aastatega paranenud, suurem osa automatiseerimise tõttu ja oli aluseks järjestamine esimene inimese genoom aastal 2000. Vähem kui kahe aastakümnega on NGS siiski ületanud Sangeri järjestamine tänu suurele läbilaskevõimele, paralleeltööle ja palju madalamatele kuludele.

Mis vahe on Sangeri järjestamisel ja järgmise põlvkonna sekveneerimisel?

Iga lisatud nukleotiid identifitseeritakse selle fluorestseeruva märgise järgi. Kriitiline erinevus Sangeri järjestuse vahel ja NGS on järjestamine maht. Samal ajal kui Sanger ainult meetod järjestused üks DNA fragment korraga, NGS on massiliselt paralleelne, järjestamine miljoneid fragmente korraga ühe jooksu kohta.

Kui täpne on Sangeri järjestus?

Sangeri järjestamine 99,99% täpsus on kliiniliste uuringute "kuldstandard". järjestamine . Kuid uuemad NGS-tehnoloogiad muutuvad kliiniliste uuringute laborites tavaliseks ka tänu nende suuremale läbilaskevõimele ja väiksematele kuludele proovi kohta.

Soovitan: